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云算GPM DNA混合圖譜分析系統
生  產  商:瑞源公司
產品編號:E01610
價       格:¥-
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常見問題Q&A


1、C/S架構什么意思?

 

C/S分別是Client和Server的首字母,也就是表示客戶端/服務器。表示我們的整套系統是由客戶端分析電腦和數據庫存儲服務器組成。服務器負責對數據存儲,客戶端電腦完成數據的分析計算功能以及數據的檢索管理功能。

 

2、包含二所的試劑盒嗎?

 

軟件可根據需要支持自行導入試劑盒,并且也支持導入人群基因頻率等信息。

試劑盒.png

 

3、軟件分析速度怎么樣?

 一般2人混合數據在5分鐘之內可以分析完成,3人混合一般十幾分鐘完成。具體分析時間會根據圖譜的質量,復雜程度以及已知信息等有所不同。

 

4、數據庫存儲數據量有多少?

我們服務器標配2T+512G固態硬盤,可以支持至少100萬份數據存儲。如果客戶有需求可以額外對容量進行擴展。

 

5、云端架構在哪里?

我們整套系統的硬件配置是包含客戶端和服務器的,所有硬件都會安裝在購買的客戶處。所有的管理權限也都交由客戶管理。

 

6、除了增加了一個數據庫管理,與其它軟件有什么區別?

 云算GPM中內置的概率分型軟件仍然是基于生物建模和MCMC計算原理開發的,這也是目前全連續法概率分型軟件采用的通用的原理。

從系統配置來講,云算GPM系統將數據存儲端與數據分析端進行了分離,可以實現多人同時分析,數據統一管理功能。

多人分析都是在自己的客戶端完成,計算負載并沒有加載到服務器上,不會因為分析人數增多,而增加服務器的負擔,不會影響計算速度。

 

7、 手頭有混合圖譜,可以拆分看看嗎?

我們近期會推出云算GPM試用活動,請關注我們官方信息以及弘德商城。也歡迎客戶與我們聯系。

 

8、 這套系統什么價位?能與全國DNA數據庫關聯嗎? 

1)云算GPM是我們引進德國專業DNA混合圖譜分析軟件進行的二次開發,其優勢在于采用了C/S架構,所有數據統一存儲在數據庫中,非常便于數據的檢索和管理。

也非常方便與其它系統進行對接,比如與實驗室的LIMS對接,我們下一步開發的目標就是將系統與DNA數據庫對接,能夠快速入庫比對。我們目前已經與國內某個開

發LIMS系統的公司建立了合作關系,在不久的將來就會實現這一功能。

 

2)整套系統配備1個服務器和2個客戶端,服務器中安裝數據存儲數據庫,2個客戶端分別安裝有一套獨立的分析軟件,可滿足兩人同時分析。系統報價請與我們當地銷售負責人聯系。

 

9、系統分析的準確率怎么樣?

云算GPM系統在正式推出之前我們已經做了大量的測試工作,并且我們也給國內某公安單位分析過一個真實案例,拆分的結果也在數據庫中完美的比中嫌疑人。

 

10、銷售是按照客戶端數量銷售嗎?

云算GPM系統標配2個客戶端和1個服務器,如果客戶有需求的話可以對客戶端數量進行擴展。

 

11、不確定貢獻者數量怎么拆分?

云算GPM系統內置的概率分型軟件除了可以手動輸入混合人數外,也支持軟件自動計算混合人數。軟件內置了根據最大等位基因數和最大似然估計法兩種方法計算混合人數,客戶可根據需要選擇計算方法,一般3人以上的混合人數計算最大似然估計法更準確。

 

12、是否經過SWGDAM驗證?

云算GPM內置的概率分型軟件在開發完成后已經根據SWGDAM概率分型軟件驗證指南以及ISFG DNA委員會關于法醫遺傳學生物統計學軟件的驗證建議進行了充分的驗證。軟件已經按照標準要求對其靈敏度、特異性和生物模型執行精度進行了驗證。并且軟件已經在歐洲各國廣泛應用,已經有上百萬個真實案件分析的經驗。

 

13、最多可以做幾個人的拆分?

支持2-5人混合樣本的拆分。

 

14、分析完結果是什么形式?圖譜還是CODIS?

數據分析完后可以以PDF或者WORD的格式導出報告。報告中包含了每個貢獻者,每個位點的可能基因型以及權重信息,也包含似然比等統計學計算結果。報告顯示內容客戶也可以根據需要自行調整。

 

15、目前國際應用情況,是否得到法庭應用?

云算GPM內置的概率分型軟件已經在歐洲各國廣泛應用,包括醫學研究所,公立或私立實驗室,警察局等,該軟件每年都會分析上萬個案件樣本。

按照SWGDAM法醫DNA實驗室常染色體STR分型解釋指南要求在混合圖譜給出包含結論時都需要給出相應的統計學解釋。

該軟件按照SWGDAM指南要求進行了驗證,并且符合SWGDAM解釋指南要求,也符合德國DNA委員會對混合斑解釋建議(The German Stain Commission: recommendations for the interpretation of mixed stains)要求,軟件分析結果可以作為法庭示證使用。

 

16、三人拆分的準確率有多高?

概率分型軟件對混合圖譜進行拆分后,會對每個貢獻者的每個位點基因型進行解釋,在報告中會給出每種可能基因型的權重信息。

客戶除了使用拆分出來的結果入庫搜索外,在有嫌疑人圖譜的情況下還可以進行似然比(LR)等統計學計算,即可幫助客戶判斷是否下包含結論,也可增加證據的確信度。

 

17、有沒有標準,拆分的可以拿來做證據?

目前在國外對混合圖譜解釋是由標準或者指南的,例如SWGDAM,FBI,German Stain Commission等都對DNA圖譜解釋有建議或指南,也都要求證據圖譜在發生匹配或者給出包含結論的時候要有統計學解釋,也才能作為法庭證據采納。

據我們所知國內還沒有具體的標準文件可以參考,但國內專家正在廣泛的調研取證,我們也會積極的配合相應的工作,應該在不久的將來就會有相應的指南文件發出。

 

18、這個軟件的拆分標準是什么?

云算GPM內置的概率分型軟件是基于全連續法的一種分型軟件。其主要計算原理是通過建立一個生物模型來計算每個等位基因的總產物量。

通過MCMC算法的迭代運算不斷優化計算其中的各個參數,直到找到能夠解釋證據圖譜的最佳基因型組合。整個計算過程比較復雜,涉及很多統計學算法,這里無法展開介紹,請關注瑞源官方發布信息或與我們聯系。

 

19、標配是多大配置?

云算GPM標準配置1個服務器和2個客戶端,服務器中安裝數據存儲數據庫,2個客戶端分別安裝有一套獨立的分析軟件,可滿足兩人同時分析。

 

20、對混合分型峰值有要求嗎?

云算GPM是復雜混合圖譜分析專家系統,不僅可以分析正常模板量產生的圖譜,對于低拷貝DNA產生的圖譜也可分析。因系統內置全連續法概率分型軟件不僅可以模擬等位基因峰,Stutter峰等,也可模擬drop-in/out,對于低拷貝DNA,圖譜中可能漏位點的情況也會給出合理的科學的解釋。

 

21、這個和STRmix相比較,那個更適合國內用戶?

STRmix是我們前期推出的一款概率分型軟件,其對混合圖譜解釋結果已得到廣泛認可,并且也在美國和新西蘭市場廣泛應用,在國內也有部分客戶使用。

但在2019年底STRmix被新西蘭政府列為對華禁售產品,我們不得不終止該產品的國內銷售活動,但已購買的客戶的技術服務我們仍然繼續提供。

我們看到在國內混合圖譜的數量越來越多,而且混合圖譜的分析也是法醫DNA實驗室的一個難點,為了推動國內混合圖譜解釋與國際接軌,解決當前混合圖譜分析的難點,我們認為繼續在國內推廣混合圖譜分析軟件是十分有意義的。

所以在得知STRmix對華禁售后就開始在市場上尋找相關可替代產品。

云算GPM就是我們引進德國MDG集團的全連續法概率分型軟件Genoproof Mixture 3二次開發而成的一整套系統。該系統包含了原始數據分析到混合數據拆分,統計學計算的整個流程。

云算GPM系統與STRmix區別在于STRmix屬于單機版軟件,而云算GPM實現了C/S架構,后期更利于二次開發與其它系統對接。兩個軟件所采用的生物模型以及計算原理都是一致的,主要功能方面,STRmix能完成的,云算GPM也能夠實現。

 

22、使用前是否需要大量樣本進行實驗室內部參數驗證?

不需要再做驗證。云算GPM內置的概率分型軟件在開發完成后已經根據SWGDAM概率分型軟件驗證指南以及ISFG DNA委員會關于法醫遺傳學生物統計學軟件的驗證建議進行了充分的驗證。軟件已經按照標準要求對其靈敏度、特異性和生物模型執行精度進行了驗證。并且軟件已經在歐洲各國廣泛應用,已經有上百萬個真實案件分析的經驗。